Posebna organizaciona celina po kojoj je Zavod za zdravsvenu zaštitu radnika Niš prepoznatljiv u ovom gradu i širem regionu je služba medicine rada koja funkcioniše na dva punka u zgradi Insituta za javno zdravlje (zgrada Higijenskog zavoda) i u dispanzeru Mašinske industrije koji se nalazi u blizini Mašinske industrije Niš.

U ovoj službi se obavljaju zdravstvene usluge: izdavanje lekarskih uverenja za zasnivanje radnog radnog odnosa, za vozače amatere, za vozače profesionalce,  produženje vozačke dozvole za lica preko 65 godina starosti, vanredni pregledi vozača, uverenja za sud i na zahtev državnih organa, uverenja za za privatno preduzetništvo, uverenja za dobijanje telefona ili, za usvajanje dece i hraniteljstvo, za smeštaj lica u dom penzionera, uverenja za nošenje oružja, za upis u školu ili na fakultet, za odlazak u inostranstvo, za sklapanje braka stranih državljana ,za sklapanje braka maloletnih lica, za produženje boravka stranih državljana, uverenje za životno osiguranje kao i izdavanje lekarskih uverenja za poslove komunalnog policajca.

Specijalisti medicine rada vrše edukaciju iz pružanja prve pomoći za zaposlene na zahtev preduzeća, kao i za vozače motornih vozila. Ukoliko kandidat za vozača motornog vozila ima potrebu da obavi obuku iz prve pomoći i da u isto vreme dobije i lekarsko uverenje za vozača dobija popust od 1500.oo dinara.

U ovoj službi se rade i ciljani očni pregled kod zaposlenih koji rade duže od 4 sata sa ekranom od strane našeg oftalmologa, a edukacija od strane specijaliste medicine rada za bezbedan I zdrav rad sa ekranom.

U službimedicine rada se vrše redovni i vanredni kontrolno-periodični pregledi radnika koji rade na radnim mestima sa povećanim rizikom. Dugogodišnje iskustvo, organizacija i stručnost u radu,  razlozi su zbog kojih je više od 600 privrednih subjekata u gradu i preko 200 privrednih subjekata van Niša poklonilo poverenje ZZZZ radnika Niš, da kontinuirano iz godine u godinu, upućuju svoje radnike na pregled i savesno poštuju i prate preporuke lekara ove Ustanove sa jedinim zajedničkim ciljem-sačuvati zdravlje radno aktivne populacije.

Periodične preglede radnika moguće je obaviti i u samoj radnoj organizaciji, jer posedujemo mobilnu terensku ekipu za ovu vrstu pregleda.

U prostorijama medicine rada u zgradi higijenskog zavoda obavljaju se ekspertizne obrade pacijenata, kako na lični zahtev tako i na zahtev radne organizacije ili Lekarske komisije, a lekari Zavodakomisijski pružaju i usluge sudsko-medicinskih veštačenja iz oblasti medicine rada. Sudski veštaci za oblast medicine rada su priznati u Srbiji a i šire. Sudski veštak prof dr Jovica Jovanović je održao veći broj uvodnih predavanja na kongresima sudskih veštaka u medicini rada iz oblasti veštačenja radne sposobnosti, zlostavljanja na radnom mestu (mobbing), povreda na radu, bolesti vezanih za rad i profesionalnih bolesti.

U okviru preventivnih akcija, a u cilju očuvanja zdravlja radno aktivne populacije Zavod organizuje sistematskih pregleda,ciljane ginekološke preglede (ultrazvuk dojki i male karlice, Papa test, kolposkopski pregled i analiza vaginalnog sekreta, a moguće je obaviti i ispitivanje koštane gustine - denzitometriju), ciljane internističke preglede (ultrazvučni pregled srca, Holter monitoring krvnog pritiska i Holter EKG-a, test fizičkim opterećenjem), preventivne preglede u cilju ranog otkrivanja malignih oboljenja i hroničnih masovnih nezaraznih bolesti (povišenog krvnog pritiska, šećerne bolesti, ispitivanje funkcije štitne žlezde i drugo).